O BBM financia suas operações através de várias fontes e tem como meta captar recursos a custos e prazos competitivos nos mercados nacional e internacional.

No mercado local, o BBM capta recursos de clientes institucionais (bancos, fundos de investimentos, fundos de pensão e seguradoras), pessoas jurídicas e clientes de private banking, principalmente por meio da emissão de CDBs e CDIs.

O Banco BBM também está  presente no mercado internacional de dívida. Foi o primeiro banco brasileiro a realizar captações de recursos em reais junto ao International Finance Corporation (IFC), braço financeiro do Banco Mundial, no montante de R$ 215, 9 milhões pelo prazo de sete anos. Conta ainda com uma emissão de eurobonds realizada em novembro de 2006 de US$150 milhões e vencimento em novembro de 2009.

Além das captações realizadas diretamente pelo Banco BBM, o banco utiliza ainda sua  filial em Bahamas e a subsidiária BBM Bank Ltd. para acessar os mercados internacionais, principalmente para a captação de recursos através de linhas de crédito de comércio exterior. Estes são principalmente utilizados para financiar os adiantamentos sobre contratos de câmbio (ACC), adiantamento sobre contratos de exportação (ACE) e operações de pagamento antecipado de exportação. Os certificados de depósito (Certificates of Deposits), e os depósitos a prazo (Time Deposits) são também utilizados para a captação de recursos.